RUNX3、P16、DAPK基因启动子DNA甲基化与非小细胞肺癌PD⁃1抑制剂疗效的关系

doi:10.3969/j.issn.1006-5725.2026.15.008

Abstract

Abstract:

Objective To investigate the association between the promoter DNA methylation of RUNX3， P16， and DAPK genes and the efficacy of programmed death receptor-1 （PD-1） inhibitors in patients with non-small cell lung cancer （NSCLC）. Methods A total of 73 patients with who NSCLC received treatment with PD-1 inhibitors in our hospital from January 2020 to January 2024 were recruited. These patients were then divided into a disease progression group （characterized by progressive disease） and a disease control group （comprising patients with complete response， partial response， and stable disease） based on the therapeutic response. The promoter DNA methylation status of the RUNX3， P16， and DAPK genes in peripheral blood samples， tumor markers， and pulmonary CT features were compared between the two groups. The influencing factors for the sustained disease progression after PD-1 inhibitor therapy were analyzed. Results Among the 73 patients， 4 achieved a complete response， 29 achieved a partial response， 25 had a stable disease state， and 15 experienced disease progression. The proportion of PD-L1-positive cases was significantly higher in the disease control group compared to that in the disease progression group （P < 0.05）. The expression levels of RUNX3， P16， and DAPK were significantly higher in the disease control group than those in the disease progression group （P < 0.05）. No statistically significant differences were detected between the two groups in CT features such as lesion density， lesion margin， pleura relationship， vascular signs， ground-glass opacity， calcification， or distal obstructive inflammation （P > 0.05）. The serum levels of carcinoembryonic antigen （CEA）， neuron-specific enolase （NSE）， cytokeratin 19 fragment （CYFRA21-1）， and cancer antigen 125 （CA125） showed no significant differences between the groups （P > 0.05）. Logistic multivariate regression analysis indicated that RUNX3 （OR = 0.257， 95%CI： 0.103 - 0.644）， P16 （OR = 0.243， 95%CI： 0.096 - 0.608）， DAPK （OR = 0.217， 95%CI： 0.087 - 0.543）， and PD-L1 positivity （OR = 0.242， 95%CI： 0.096 - 0.607） were independent influencing factors for sustained disease progression in NSCLC patients after PD-1 inhibitor therapy （P < 0.05）. Conclusions Promoter DNA methylation of RUNX3， P16， and DAPK is significantly associated with the efficacy of PD-1 inhibitors in the treatment of NSCLC. Moreover， a hypomethylation status is correlated with more favorable therapeutic responses in patients.

Key words: non-small cell lung cancer, PD-1 inhibitor, DNA methylation

CLC Number:

R734.2

Hui LI,Zhirong YANG,Xianwei WANG,Yuwei FENG,Luyao AO. Association between promoter DNA methylation of RUNX3， P16 and DAPK genes and efficacy of PD-1 inhibitors in non-small cell lung cancer[J]. The Journal of Practical Medicine, 2026, 42(15): 2730-2736.

Figures/Tables 5

Tab.1

Comparison of clinical data between the two groups of NSCLC patients"

因素	疾病进展组（n = 15）	疾病控制组（n = 58）	$χ 2$ /t值	P值
年龄（x ± s）/岁	65.03 ± 12.91	62.73 ± 11.05	0.694	0.490
性别			0.380	0.538
男	8（53.33）	36（62.07）
女	7（46.67）	22（37.93）
BMI（x ± s）/（kg/m²）	21.06 ± 1.09	20.89 ± 1.14	0.519	0.605
吸烟	8（53.33）	28（48.28）	0.122	0.727
饮酒	7（46.67）	23（39.66）	0.242	0.623
病理类型			0.001	0.987
鳞癌	6（40.00）	25（43.10）
腺癌	9（60.00）	33（56.90）
肿瘤T分期			0.368	0.832
T1	4（26.67）	20（34.48）
T2	9（60.00）	32（55.17）
T3	2（13.33）	6（10.34）
肿瘤N分期			1.180	0.554
N0	3（20.00）	20（34.48）
N1	10（66.67）	31（53.45）
N2	2（13.33）	7（12.07）
肿瘤最大径（x ± s）/mm	4.98 ± 1.72	5.31 ± 1.95	0.597	0.552
分化程度			0.526	0.769
低分化	8（53.33）	26（44.83）
中分化	5（33.33）	20（34.48）
高分化	2（13.33）	12（20.69）
淋巴结转移	11（73.33）	36（62.07）	0.659	0.417
PD-L1阳性	7（46.67）	18（31.03）	1.293	0.255
EGFR T790 M位点突变	5（33.33）	18（31.03）	0.029	0.864

Tab.1

Tab.2

Tab.3

Tab.4

Tab.5

References 32

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组别	例数	RUNX3	P16	DAPK
疾病控制组	58	34.2 ± 6.1	56.5 ± 8.2	76.3 ± 11.9
疾病进展组	15	23.5 ± 3.7	40.9 ± 5.3	60.5 ± 9.1
t值		6.472	6.981	4.784
P值		< 0.001	< 0.001	< 0.001

组别	例数	CEA/（ng/mL）	NSE/（ng/mL）	CYFRA21-1/（ng/mL）	CA125/（U/mL）
疾病控制组	58	162.35 ± 39.71	26.51 ± 3.34	13.51 ± 2.61	144.51 ± 29.61
疾病进展组	15	167.41 ± 32.50	28.03 ± 4.19	15.12 ± 3.78	151.03 ± 28.05
t值		0.513	1.301	1.553	0.794
P值		0.609	0.198	0.125	0.430

征象类别	具体表现	疾病进展组（n = 15）	疾病控制组（n = 58）	χ2值	P值
病灶密度	均匀	5（33.33）	20（34.48）	0.008	0.929
	不均匀	5（33.33）	21（36.21）
	空泡征	1（6.67）	3（5.17）
	空洞征	4（26.67）	14（24.14）
病灶边缘	光滑	4（26.67）	9（15.52）	0.973	0.324
	不光滑	11（73.33）	49（84.48）
与胸膜关系	正常	4（26.67）	18（31.03）	0.126	0.723
	异常	11（73.33）	40（68.97）
血管征象	正常	5（33.33）	20（34.48）	0.592	0.744
	血管纠集征	5（33.33）	19（32.76）
	支气管血管束变粗	3（20.00）	10（17.24）
	支气管截断征	2（13.33）	9（15.52）

因素	b	S_b	Wald χ²	P值	OR	95%CI
PD-L1	-1.417	0.582	5.928	0.001	0.242	0.096 ~ 0.607
RUNX3	-1.358	0.602	5.089	0.001	0.257	0.103 ~ 0.644
P16	-1.416	0.702	4.069	0.001	0.243	0.096 ~ 0.608
DAPK	-1.528	0.639	5.718	0.001	0.217	0.087 ~ 0.543

Association between promoter DNA methylation of RUNX3， P16 and DAPK genes and efficacy of PD-1 inhibitors in non-small cell lung cancer

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