尿液蛋白激酶Y基因启动子位点甲基化在前列腺癌早期诊断中的价值

doi:10.3969/j.issn.1006-5725.2024.05.017

摘要/Abstract

摘要：

目的探讨尿液蛋白激酶（PRKY）基因启动子位点甲基化在前列腺癌（PCa）早期诊断中的临床价值。方法收集50例疑似PCa患者的尿液，提取DNA后，通过定量甲基化特异性PCR（qMSP）法检测PRKY基因启动子位点cg05163709、cg08045599及cg05618150甲基化水平，同时将患者分为良性前列腺增生（BPH）组和PCa组，并分析两组患者临床指标差异以及两组患者尿液中的PRKY基因启动子位点甲基化状态。建立受试者工作特征曲线（ROC），计算曲线下面积（AUC），分析其在PCa中的诊断价值，并联合临床指标进行联合诊断。结果 PCa患者尿液标本中cg05163709和cg05618150甲基化率明显高于BPH患者，其中cg05163709甲基化诊断PCa的AUC为0.762，敏感度为86.70%。与前列腺特异性抗原（tPSA）等临床指标相比，PRKY甲基化在PCa早期筛查中表现更好。cg05618150甲基化与前列腺特异抗原密度（PSAD）联合诊断的AUC为0.787，敏感度为86.70%；cg05163709甲基化与PSAD联合诊断PCa的AUC为0.855，特异度为95.00%。结论尿液PRKY基因启动子cg05163709和cg05618150位点甲基化在诊断PCa上具有较高的敏感度和特异度，有望成为PCa早期诊断的生物标志物。

关键词: 前列腺癌, 尿液蛋白激酶Y, 早期诊断, 甲基化, 临床价值

Abstract:

Objective To explore the clinical value of methylation at promoter sites of urine protein kinase Y-linked （PRKY） gene in the early diagnosis of prostate cancer（PCa）. Methods Urine samples were collected from 50 suspected PCa patients. After extracting DNA， the methylation levels of the PRKY gene promoter sites cg05163709， cg08045599， and cg05618150 were detected using quantitative methylation-specific PCR （qMSP）. Simultaneously， the patients were divided into the benign prostatic hyperplasia （BPH） group and the PCa group. The differences in clinical indicators between the two groups were analyzed， as well as the methylation status of the PRKY gene promoter sites in the urine of the two groups of patients. The receiver operating characteristic （ROC） curve of PRKY promoter sites methylation was established， and the area under the curve （AUC） was calculated to analyze the diagnostic value of PRKY promoter sites methylation in PCa， and to perform combined diagnosis with clinical indicators. Results The methylation rates of cg05163709 and cg05618150 in urine specimens of PCa patients were significantly higher than those of BPH patients. The AUC for cg05163709 methylation in diagnosing PCa was 0.762， with a sensitivity of 86.70%. It showed better performance in early screening for PCa compared to total prostate specific antigen （tPSA）， percentage free prostate specific antigen（f/tPSA）and prostate specific antigen density （PSAD）index. We found that the AUC for cg05618150 methylation in conjunction with PSAD in diagnosing PCa was 0.787， with a sensitivity of 86.70%. The AUC of cg05163709 methylation and PSAD in the joint diagnosis of PCa was 0.855， and the specificity could reach 95.00%. Conclusion The methylation of urine PRKY gene promoter sites cg05163709 and cg05618150 shows high sensitivity and specificity in diagnosing PCa， making them promising biomarkers for early detection of PCa.

Key words: prostate cancer, protein kinase Y-linked gene, early diagnosis, methylation, clinical value

中图分类号:

R737.25

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图/表 6

表1

表2

表3

图1

表4

图2

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试剂名称	体积（μL）	试剂名称	体积（μL）
qPCR Mix	12.5	qPCR Mix	12.5
PPmix1	2.5	F-cg05163709	0.3
		R-cg05163709	0.3
		P-cg05163709	0.2
		F-cg05618150	0.3
		R-cg05618150	0.3
		P-cg05618150	0.2
		F-ACTB	0.25
		R-ACTB	0.25
		P-ACTB	0.15
		ddH₂O	0.25
Total	15	total	15

试剂名称	体积（μL）	试剂名称	体积（μL）
qPCR Mix	12.5	qPCR Mix	12.5
PPmix2	2.5	F-cg05618150	0.3
		R-cg05618150	0.3
		P-cg05618150	0.2
		F-cg08045599	0.3
		R-cg08045599	0.3
		P-cg08045599	0.2
		F-ACTB	0.25
		R-ACTB	0.25
		P-ACTB	0.15
		ddH₂O	0.25
Total	15	total	15

项目	PCa（n = 30）	BPH（n = 20）	Z/χ²值	P 值
年龄（岁）	72.00 ± 5.33	69.75 ± 6.77	1.25	0.220
tPSA［M（P₂₅，P₇₅），ng/mL］	9.31（6.01，15.95）	7.39（3.39，12.23）	1.34	0.181
f/tPSA［M（P₂₅，P₇₅）］	0.12（0.10，0.19）	0.16（0.13，0.22）	1.90	0.058
PSAD［M（P₂₅，P₇₅）］	0.20（0.10，0.42）	0.12（0.05，0.18）	2.68	0.007
cg05163709甲基化状态［例（%）］			3.16	0.002
甲基化	26（86.67）	8（40.00）
非甲基化	4（13.33）	12（60.00）
cg05618150甲基化状态［例（%）］			2.43	0.015
甲基化	16（53.33）	3（15.00）
非甲基化	14（46.67）	17（85.00）
cg08045599甲基化状态［例（%）］			1.45	0.870
甲基化	7（23.33）	2（10.00）
非甲基化	23（76.67）	18（90.00）

指标	敏感度（%）	特异度（%）	AUC	95%CI	P值
cg05163709甲基化	86.7	60	0.763	0.629 ~ 0.898	< 0.001
cg05163709甲基化联合tPSA	86.7	60	0.788	0.663 ~ 0.914	< 0.001
cg05163709甲基化联合f/tPSA	86.7	65	0.795	0.667 ~ 0.919	< 0.001
cg05163709甲基化联合PSAD	73.3	95	0.855	0.740 ~ 0.963	< 0.001
cg05618150甲基化	53.3	85	0.692	0.540 ~ 0.843	0.013
cg05618150甲基化联合tPSA	70.0	70	0.682	0.528 ~ 0.835	0.005
cg05618150甲基化联合f/tPSA	66.7	75	0.723	0.581 ~ 0.866	0.002
cg05618150甲基化联合PSAD	86.7	70	0.787	0.657 ~ 0.916	< 0.001

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