实用医学杂志 ›› 2022, Vol. 38 ›› Issue (1): 73-78.doi: 10.3969/j.issn.1006⁃5725.2022.01.014
食管鳞癌预后生物标志物的挖掘及其通路分析
田琴琴1 李昂2 李佳莹2 谢俞宁2 仵红娇2 张雪梅1，2
华北理工大学1 生命科学学院，2 公共卫生学院（河北唐山 063210）
Analysis of prognostic biomarkers and pathways in esophageal squamous cell carcinoma
TIAN Qinqin*，LI Ang，LI Jiaying，XIE Yuning，WU Hongjiao，ZHANG Xuemei.
College of Life Sciences，North China University of Scienceand Technology，Tangshan 063210，China
摘要：
目的 分析食管鳞癌（ESCC）组织中的差异表达基因（DEGs）与预后的关系，并探索影响食 管鳞癌发生的关键通路。方法 R 语言 limma 程序对基因表达数据库（GEO）与癌症基因图谱（TCGA） 数据库的食管鳞癌转录组数据进行差异表达基因进行分析。Cox 回归模型筛选食管鳞癌独立预后基 因。TIMER 数据库进行独立预后基因与免疫浸润细胞之间的相关性分析。基因集富集分析（GSEA）和 基因集变异分析（GSVA）预测差异基因的调控网络。结果 分析三个GEO数据集（GSE17351、GSE20347 和 GSE100942）和 TCGA 的差异表达基因结果，得到 55 个共同差异表达基因（40 个上调和 15 个下调基因）。 对 55 个基因进行单因素 Cox 回归分析，发现 TTK、CHEK1、FEN1、KIF14、NUP155、KIF23 和 CENPE 与食 管鳞癌患者总体生存时间相关。对 7 个预后相关基因进行多因素 Cox 回归分析，发现 TTK 可作为食管 鳞癌的独立预后因素。GSEA 和 GSVA 结果显示 TTK 可能通过调节细胞周期、DNA 损伤修复等通路 影响食管鳞癌的发生发展。结论 TTK 高表达是一种预后不良因素，可能作为食管鳞癌的潜在预后 标志物。
