实用医学杂志 ›› 2022, Vol. 38 ›› Issue (14): 1736-1742.doi: 10.3969/j.issn.1006⁃5725.2022.14.005
李英娜 董兰 刘婉珊 全林菲 何凤
广州市第一人民医院肾内科(广州 510180)
Pathogenesis of early diabetic nephropathy:A bioinformatics analysis
LI Yingna,DONG Lan,LIU Wanshan, QUAN Linfei,HE Feng.
Department of Nephrology,Guangzhou First People′s Hospital,Guangzhou 510180,China Corresponding author:HE Feng E⁃mail:eyhefeng@scut.edu.cn
摘要:
目的 利用生物信息学筛选分析早期糖尿病肾病的差异基因表达,探讨糖尿病肾病发病机 制并为其提供新的分子治疗靶点。方法 通过 GEO 数据库获取数据集 GSE142025 行生物信息学分析,筛选早期糖尿病肾病组(eDN 组)相对对照组(NC 组)差异表达基因。GSEA 分析差异表达基因的富集通路, 通过蛋白质相互网络(PPI)分析鉴定 HUB 基因。采用免疫组化和 RT⁃qPCR 检测目标基因在肾组织中的相 对表达水平。结果 以 P < 0.05 和 | |log2FC > 1 为标准,筛选得到 eDN 组有 1 859 个差异表达基因,其中有 1 063 个上调,有 796 个下调。GSEA 行差异基因的 KEGG 通路富集显示 eDN 组在“JAK⁃STAT 通路”、“细胞 因子受体通路”、“趋化因子信号通路”、“细胞黏附分子通路”、“细胞外基质受体相互作用通路”等显著 上调。CCR2 作为 HUB 基因在 eDN 组中表达显著上调;免疫组化及 RT⁃qPCR 结果显示一致,eDN 组中 CCR2 相对表达水平明显高于 NC 组(均 P < 0.05)。结论 KEGG 分析功能富集主要显示炎症通路激活,而 CCR2 在早期糖尿病肾病的肾组织中表达显著上调,提示其可能在早期糖尿病肾病发生发展中起着重要 作用。