实用医学杂志 ›› 2022, Vol. 38 ›› Issue (22): 2838-2844.doi: 10.3969/j.issn.1006⁃5725.2022.22.014
基于疾病基因表达谱和药物转录组的抗高尿酸血症药物“重定位”
逄成章1 刘文彬2 金小宝1
1 广东药科大学生命科学与生物制药学院(广州 510006);2 广东省生物活性药物研究重点实验室(广州 511436)
“Relocalization”of anti⁃hyperuricemia drugs based on disease gene expression Profile and Drug transcrip⁃ tome
PANG Chengzhang*,LIU Wenbin,JIN Xiaobao
School of Life Sciences and Biopharmaceutics,Guangdong Pharmaceutical University,Guangzhou 510006,China
摘要:
目的 采用疾病基因表达谱和药物转录组相结合的老药新用策略,从老药中筛选具有抗高 尿酸血症的药物。方法 通过高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)转录组数据库筛选 HUA 差异表达基因, 使用DAVID数据库与STRING平台对差异基因进行筛选与分析。通过Connectivity Map数据库从候选药物中 筛选预测抗HUA药物,选择富集分数较高的药物与差异表达核心靶点,利用SwissDock平台进行分子对接。 CCK⁃8 法检测候选抗 HUA 药物对 HK⁃2 细胞活力的影响,验证候选药物对 HUA 细胞模型的黄嘌呤氧化酶 活性和尿酸浓度的影响。结果 在 HUA 转录组数据库中,获得 1 492 个差异基因,其中下调基因 810 个, 上调基因 682 个,差异基因涉及 HDASC deacetylate histones、IL⁃7、UB⁃specific processing proteases 等通路;通 过 Connectivity Map 数据库预测 15 个药物具有抗 HUA 潜力,分子对接表明阿维菌素与核心靶点 IL⁃1β、 TNF、CXCL2 和 IL⁃6 的结合能分别为-7.68、-7.97、-6.25、-6.73 kcal/mol;细胞实验表明,12.5 ~ 100 μg/mL 药物浓度范围内阿维菌素具有良好的细胞安全性、抑制黄嘌呤氧化酶活性和降低尿酸作用(P < 0.05)。 结论 通过疾病基因表达谱和药物转录组数据相结合策略发现阿维菌素具有抗高尿酸潜力。