实用医学杂志 ›› 2023, Vol. 39 ›› Issue (9): 1079-1085.doi: 10.3969/j.issn.1006⁃5725.2023.09.003
何婉珊1，2 洪小山2 陈冠桥1 陈斌1 文斌2 林育3 韦之富4 罗喜平1，2
1 广州医科大学（广州 511436）；2 广东省妇幼保健院妇科（广州 511400）；3 南方医科大学（广州 510515）； 4 暨南大学附属顺德医院妇科（广东佛山 528000）
Screening of gene differential expression of NSUN2 in ovarian cancer cells based on transcriptome sequenc⁃ ing technology
HE Wanshan* ，HONG Xiaoshan，CHEN Guanqiao，CHEN Bin，WEN Bin，LIN Yu，WEI Zhifu， LUO Xiping
Guangzhou Medical University，Guangzhou 511436，China；*Department of Gynecology, the Guang⁃ dong Women and Children Hospital, Guangzhou 511400, China
摘要：
目的 应用 RNA⁃seq 技术研究 NSUN2 对卵巢癌细胞株 A2780 基因表达的影响，为阐明 NSUN2 在卵巢癌症发生发展中的作用提供理论依据。方法 慢病毒介导的 RNA 干扰技术抑制 A2780 细 胞中 NSUN2 的表达。以转染空载体的细胞为对照，使用 RNA⁃seq 技术对干扰细胞株进行基因谱高通量测 序分析，筛选出差异表达的基因。并通过 KEGG Pathway、GO 分析和 GSEA 富集分析，探索 NSUN2 调控的 差异基因主要参与的相关信号通路和生物学过程。结果 与对照组细胞相比，NSUN2 敲低的 A2780 细胞 株有 1 642 个差异表达的基因，其中上调基因有 1 020 个，下调基因有 622 个；通过 GO 分析、KEGG Pathway 和 GSEA 富集分析发现差异表达基因主要富集在 hedgehog 信号通路、P53 等信号通路上，参与了病毒转录、 翻译起始和调节等生物过程；通过对 P53 信号通路的相关基因进一步分析，筛选出与改通路相关的 3 个关 键基因（ZMAT3、EI24 和 CCND2），RT⁃qPCR 验证其表达结果与测序结果相符。结论 A2780 sh⁃NSUN2 组 与 A2780 sh⁃NC 组的基因表达谱间存在明显的差异，其差异基因主要富集于 P53 信号通路。在卵巢癌中 NSUN2可能通过调控P53信号通路相关因子的表达，从而调控了卵巢癌的发生发展。
